ユーザー用ディレクトリのフルパスはどのようになるでしょうか？
CMSやCGIの設定に必要です。

/var/www/virtual/お客様ドメイン名/

例）お客様ドメイン名がobitastar.co.jpの場合
/var/www/virtual/obitastar.co.jp/がフルパスになり、
公開領域はhtdocsになり、以下のようになります。
/var/www/virtual/obitastar.co.jp/htdocs/